PCR技術的本質是核酸擴增技術，重復“變性(denature)→退火(anneal)→引物(primer)延伸(extension)"過程至25-40個循環(huán)，呈指數級擴大待測樣本中的核酸拷貝數，達到體外擴增核酸序列的目的。

 PCR的基本原理：

在PCR技術的發(fā)展過程中，熱穩(wěn)定DNA聚合酶的發(fā)現(xiàn)以及溫度循環(huán)的自動化大大簡化了PCR程序，使PCR的自動化成為可能，并在此基礎上不斷發(fā)展和改進。
PCR基因擴增儀的工作原理：
    PCR基因擴增儀工作關鍵是溫度控制。
1.水浴鍋控溫：以不同溫度的水浴鍋串聯(lián)成一個控溫體系。
2.壓縮機控溫：由壓縮機自動控溫，金屬導熱，控溫較代PCR基因擴增儀方便，但壓縮機故障率高，邊緣效應及溫度overshooting現(xiàn)象嚴重。
3. 半導體控溫：由半導體自動控溫，金屬導熱，控溫方便，體積小，相對穩(wěn)定性好。
4. 離心式空氣加熱控溫：由金屬線圈加熱，采用空氣作為導熱媒介，溫度均一性好，各孔擴增效率高度一致，滿足熒光定量PCR的高要求。
PCR擴增儀的分類與結構：
    PCR擴增儀的種類總體來說，可以分成兩大類，即普通PCR擴增儀和實時熒光定量PCR擴增儀。
1、 普通PCR擴增儀
1）.普通PCR擴增儀即通常所謂的定性PCR擴增儀。
2）.梯度PCR儀是由普通PCR儀衍生出的帶梯度PCR功能的基因擴增儀。
3）.原位PCR儀是由普通PCR儀衍生出的帶原位擴增功能的基因擴增儀。
2、 實時熒光定量PCR擴增儀
1.金屬板式實時定量PCR儀，還可作為普通PCR儀使用，有的甚至帶梯度功能，可容納的樣本量大，無需特殊耗材，但溫度均一性欠佳，有邊緣效應，標準曲線的反應條件難以做到與樣品wan全一致。
2.離心式實時定量PCR儀的PCR擴增樣品槽被設計為離心轉子，溫度均一性好，但可容納樣品量少，有的需用特殊毛細管作樣品管，增加了使用成本，也不帶梯度功能。
3.各孔控溫的定量PCR儀的不同樣品槽分別擁有的智能升降溫模塊，各孔控溫，適合多指標快速檢測，可實現(xiàn)任意梯度反應，但上樣不如傳統(tǒng)方法方便，而且需要du特的扁平反應管，使用成本較高。